Можно ли одновременно применять льготы участника проекта «Сколково» и льготы аккредитованной ИТ-компании?

Нет, с 01.01.2026 совмещение не допускается: компания, одновременно являющаяся участником проекта и аккредитованной ИТ-компанией, применяет только льготы участника проекта. Выбирать между двумя наборами льгот и уведомлять ФНС о выборе не нужно — выбора нет: если участник не пользуется льготами проекта, льготы для аккредитованных ИТ-компаний ему всё равно недоступны, и вернуться к ним «через год» тоже нельзя. Запрет привязан к самому статусу участника проекта, а не к тому, пользуетесь ли вы его льготами.

Норма — п. 5 ст. 427 НК РФ: тарифы страховых взносов, установленные подп. 1.1 п. 2 и пунктами 2.2, 2.2-1 и 2.2-2 ст. 427, не применяются организациями, имеющими статус участника проекта. Абзац введён Федеральным законом от 28.11.2025 № 425-ФЗ и действует с 01.01.2026, к периодам 2025 года он не относится; текст закона — на официальном портале правовой информации: publication.pravo.gov.ru/document/0001202511280017.

Участник проекта платит взносы по своему тарифу — 15% с части выплат работнику, превышающей 1,5 МРОТ (п. 2.4 ст. 427 НК РФ). Для сравнения, у аккредитованных ИТ-организаций с 2026 года тариф другой: 15% в пределах единой предельной величины базы и 7,6% сверх неё (п. 2.2-2 ст. 427 НК РФ); в 2025 году он составлял 7,6% и в пределах базы, и сверх неё (п. 2.2-1 ст. 427 НК РФ).

ИТ-ипотека и отсрочка для сотрудников — меры Минцифры, а не налоговые льготы: их условия уточняйте в Минцифры. Вопросы применения самих налоговых норм — в свою налоговую инспекцию, обзор льгот участника — на sk.ru/tax-facilities/.